第 一，研究開發(fā)投入與產(chǎn)出缺乏強相關(guān)性，即使研發(fā)成功，研發(fā)成果也相對缺乏國際競爭力。
實踐表明．我國高新技術(shù)企業(yè)研發(fā)投入和研發(fā)產(chǎn)出存在弱相關(guān)性，企業(yè)花在研究開發(fā)活動的費用太多是無效的，并沒有直接轉(zhuǎn)化為企業(yè)的技術(shù)資產(chǎn)。高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)具有高風險特征，高技術(shù)企業(yè)具有極高的技術(shù)風險、市場風險和財務風險，企業(yè)研究開發(fā)失敗的概率比較大。
“二八”原則在高新技術(shù)企業(yè)研究活動中的作用非常明顯，即“20％-30％的高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)化的巨大成功是以70％-80％的高新技術(shù)企業(yè)的失敗作為代價的。研發(fā)活動其有高風險性，任正非坦言“研發(fā)是很費錢的事”，“研發(fā)要做就要做大，小打小鬧不如不做”。雖然我國高新技術(shù)企業(yè)自主創(chuàng)新活動相當廣泛，研發(fā)力度較大，但是大多為“小打小鬧”型企業(yè)，自主創(chuàng)新能力提升甚微，自主創(chuàng)新效益不夠明顯．往往半途而廢．終放棄技術(shù)，將重點轉(zhuǎn)向了品牌管理。即使企業(yè)研發(fā)成功，研發(fā)成果也相對缺乏國際競爭力?？傮w看中國高新技術(shù)產(chǎn)業(yè)在國際產(chǎn)業(yè)分工中仍處于較低層次。
第二，研究開發(fā)投入對自主創(chuàng)新能力建設(shè)的貢獻率比較低，產(chǎn)學研分離，投入不能有效的轉(zhuǎn)化為產(chǎn)出。
我國高新技術(shù)企業(yè)研究開發(fā)規(guī)模不斷擴大，投入強度屢創(chuàng)歷史極高水平。然而．相對投入的高發(fā)展，我國科技投入產(chǎn)出則顯滯后。
根據(jù)國 家科技部的《中國高新披術(shù)企業(yè)自主創(chuàng)新能力分析報告》，我國每年取得科技成果的轉(zhuǎn)化率只有20％左右，形成規(guī)模效益的只有15％．約80％處于閑置狀態(tài)。而且這20％轉(zhuǎn)化的科技成果所生產(chǎn)的一半以上尚處于通過外延擴張的發(fā)展態(tài)勢，在產(chǎn)業(yè)鏈延伸、附加值提高方面仍有待進一步的加強。
第三，中國高新技術(shù)企業(yè)普遍缺乏持續(xù)成長的能力，由持續(xù)的資金投入引起的財務風險較大，限制我國高新技術(shù)企業(yè)發(fā)展的主要瓶頸之一是缺乏有效的金融支持環(huán)境。
一方面，高新技術(shù)企業(yè)所需研究開發(fā)成本較高．自身難以獨立承擔。新技術(shù)產(chǎn)業(yè)具有高投入、高風險和高收益等特點．其發(fā)展過程對資余的需求量很大，其成本是傳統(tǒng)企業(yè)的10倍-20倍。前期研發(fā)費用高，世界領(lǐng)域內(nèi)的一些大規(guī)模企業(yè)的研發(fā)費用動輒就在每年幾十億美元以上，后期科技成果轉(zhuǎn)化等所需要的費用更是呈l倍百倍的增加，任何個商新技術(shù)倉業(yè)都難以獨立承擔。
另一方面，我國高新技術(shù)企業(yè)資金來源渠道窄，企業(yè)財務缺乏持續(xù)能力而導致技術(shù)創(chuàng)新失般的風險非常大。我國高新技術(shù)企業(yè)起步晚，企業(yè)規(guī)模較小，所有者投入資本小，加上后期自我積累能力低，企業(yè)自身資金實力較低。風險投資業(yè)在國內(nèi)剛剛起步，無法提供充足的資金支持高新技水企業(yè)的成長。同時，由于缺少為高新企業(yè)融資的擔保機構(gòu)．致使處于創(chuàng)業(yè)初期與成長階段的高新技術(shù)企業(yè)融資普遍困難，很難取得規(guī)模經(jīng)濟效益。
加上在經(jīng)營過程中，沒有及時納入國 家扶持計劃．得不到國 家資金的強有力支持，高新技術(shù)企業(yè)普遍缺乏資金來源，而技術(shù)自身的特點以及科學技術(shù)更新速度呈趨快趨勢，對企業(yè)研發(fā)的持續(xù)性要求非常高，因此由于缺乏資金來源導致技術(shù)創(chuàng)新失敗的風險非常太。
第四，我國高新技術(shù)企業(yè)管理能力普遍較低，制約高新技術(shù)企業(yè)發(fā)展。
不同管理模式對高新技術(shù)企業(yè)自豐創(chuàng)新能力育較大影響，自主創(chuàng)新能力與企業(yè)管理能力證相關(guān)。
企業(yè)的技術(shù)創(chuàng)新活動從立項到終產(chǎn)品銷售到企業(yè)日常管理過程的環(huán)節(jié)中，任何一個環(huán)節(jié)出錯都能導致失敗。任何一項技術(shù)，即使設(shè)計無缺陷，企業(yè)管理水平的落后也會使其無疾而終。我國高新技術(shù)企業(yè)規(guī)模普遍較小，管理水平落后．嚴重限制了高新技術(shù)企業(yè)的發(fā)展。
